非淋菌性尿道炎 (nongonococcal urethritis，NGU) 是男性常見的泌尿生殖道疾病，泛指除淋球菌以外的其他病原體感染而引起的尿道炎。非淋菌性尿道炎通常在不安全性接觸 (包括陰道交、肛交或口交期間的體液交流中傳播。
非淋菌性尿道炎通常由細菌感染引起，但亦可以由病毒或微生物引起。
研究指出，沙眼衣原體 ( chlamydia trachomatis， CT)、生殖支原體 ( Mycoplasma Genitalium，MG)、解脲脲原體(Ureaplasma Urealyticum，UU)和人型支原體 (Mycoplasma Hominis，MH)是非淋菌性尿道炎 最常 見 的 病 原 體。其 中，沙眼衣原體感 染 率 為 11% – 50%，生殖支原體 為 6% – 50%，解脲脲原體 為 11% – 26%，人型支原體 為 1% – 4.1%。其他非淋菌性尿道炎病原體還包括微小脲原體 (Ureaplasma Parvum，UP)、腺病毒 (Adenoviruses) 、陰道毛滴蟲(Trichomonas Vaginalis，TV) ，單 純 皰 疹 病 毒 (Herpes Simplex Virus， HSV) 、副流感嗜血桿菌 (Haemophilus Parainfluenzae) 等。
衣原體
衣原體感染 (又名披衣菌感染) 是導致非淋菌性尿道炎的最常見原因 (患者當中約50％被驗出有衣原體)。衣原體感染主要由名為衣原體的病原體引起。根據世界衛生組織 估計，每年約有 9 200 萬新發病例。衣原體是一種細菌，存活於患者的體液，包括精液和陰道分泌物等，同時存活於子宮頸的細胞內、尿道及直腸，有時亦存在於喉嚨和眼睛。衣原體很容易透過性接觸傳播，故所有性活躍人士，就算沒有多個性伴侶，如接觸到帶菌者的體液分泌，都有機會被衣原體感染或把細菌傳播。
衣原體可侵襲陰莖、陰道、子宮頸、子宮、肛門，衣原體也可感染覆蓋眼白（結膜）和咽喉的粘膜。不論男性或女性，感染衣原體後若不接受治療，可引起嚴重的性器官感染：
盤腔炎可導致女性不育。此外，感染衣原體會增加女性患上子宮頸癌及宮外孕的可能性。若孕婦感染衣原體，可在分娩把衣原體傳染給嬰兒，新生嬰兒可能會得嚴重眼結膜炎及肺炎而引致永久性傷害。
感染衣原體，患者一般沒有明顯病徵，高達80%的女性和25%的男性感染衣原體後並無明顯症狀，即使染病亦不察覺和沒有接受治療，因此感染者往把衣原體傳染了性伴侶而不自知。然而，如果患者及早接受治療，衣原體並非不治之症，患者服用經由醫生處方的抗生素可以治愈。此外，每次性接觸時正確使用安全套，亦可以減低受衣原體感染的機會。
支原體
支原體是一種沒有細胞壁的細菌，比一般細菌微細，常寄居在人體的各個部位。支原體有200多種，大部份都無害，然而當中的肺炎支原體(Mycoplasma Pneumoniae)、生殖支原體、人型支原體、解脲支原體、微小脲原體(Ureaplasma Parvum)可導致嚴重的後果。生殖器支原體、人型支原體、解脲支原體及微小脲原體會經性接觸傳染，並引起泌尿生殖道感染或其他身體問題：
如孕婦感染支原體，有機會導致宮外孕、早產或流產，孕婦在懷孕或生產時，亦有機會把支原體感染嬰兒，使新生兒出現體重不足、肺炎或敗血症。
